Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrit3W8DXL4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms