Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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