Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn9Q9Z0S7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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