Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clip2Q9Z0H8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clip2Q9Z0H8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms