Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PapolbQ9WVP6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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