Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms