Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

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Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms