Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trpc2Q9R244 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms