Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf4Q9QZS2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms