Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col4a3Q9QZS0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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