Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms