Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp1Q9QY53 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms