Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad18Q9QXK2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms