Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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