Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms