Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TefQ9JLC6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TefQ9JLC6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms