Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nectin3Q9JLB9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms