Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chrac1Q9JKP8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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