Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms