Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms