Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r46Q9EQ45 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms