Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Tlr1Q9EPQ1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tlr1Q9EPQ1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms