Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnft1Q9DCN7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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