Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MNCb-2875Q9DCB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MNCb-2875Q9DCB3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms