Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf6Q9DBU5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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