Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms