Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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