Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp12Q9D9M2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp12Q9D9M2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp12Q9D9M2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp12Q9D9M2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp12Q9D9M2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp12Q9D9M2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp12Q9D9M2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp12Q9D9M2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms