Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gtf3c6Q9D8P7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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