Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Capn9Q9D805 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn9Q9D805 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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