Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms