Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms