Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms