Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al3Q9D4U4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms