Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms