Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms