Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx29Q9D3S3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx29Q9D3S3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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