Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy3Q9D394 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms