Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms