Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spns3Q9D232 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms