Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NkapQ9D0F4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms