Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms