Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc47Q9D024 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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