Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx7Q9CY18 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms