Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms