Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NubplQ9CWD8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms