Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms