Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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