Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms