Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccer1Q9CQL2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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